Procesamiento de Datos
Ahora cargaremos los datos que se van analizar y un archivo plano con información que le diga a Qiita como se generaron los datos.
El archivo con la información de las muestras tiene toda la metadata biológica asociado con las muestras y la información sobre los pasos técnicos específicos de la muestra. Para más información sobre los archivos de información de la preparación de los datos documentación de Qiita.
Regresamos a la página de “unload files” y se cargaran los datos y el archivo con la metadata, los archivos aparecerán cargados con una notificación del 100%. Cuando los archivos esten completados, puede dar clic “go to study description” . Luego, clic en el botón “Add New Preparation”.
Asigne un nombre a la preparación de los archivos y seleccione el archivo del metadata de las muestras “prep_info.txt” y seleccione el tipo de dato analizar en el caso de los archivos de practica seleccionamos “16s”, opcionalmente puede seleccionar el tipo de investigación y hacer clic “Create new preparation” esto lo redirecciona al precesamiento de la información de preparación. Se visualizará en el menú de la izquierda el tipo de datos que se está elaborando.
Como dueño del estudio en su cuenta, tendrá la opción de eliminar la preparación, sin embargo una vez creado el análisis a partir del archivo de preparación no se podrá eliminar.
En la pestaña de “Proccessing” seleccione el tipo de archivo analizar en el caso de los datos de práctica se utiliza la opción “FASTQ - None”, automáticamente Qiita asocia los archivos cargados con las muestras correspondientes al archivo de preparación con la metadata. El metadata de los archivos tiene una columna llamada “run_prefix” que asocia la columna “sample_name” con el nombre del archivo para la muestra en particular. Si no los cargará de manera automática puede jalar el archivo que va analizar y colocarlo en la columna que corresponda y finalmente clic en “add files”.
En el menu de la izquierda seleccione 16s y se mostrará una red de procesamiento, esto necesita tiempo para cargarse, esta red se actualiza cada 5 segundos.
Los archivos Fastq para la preparación de los análisis esta representada por un solo objeto en la red llamada [usuario](FASTQ). Se debe hacer clic en el objeto y aparecerá la opción de “process” para realizar el análisis o “eliminate” para eliminarlo, además hay una lista de archivos asociados al objeto. Tambien, se podrá realizar un resumen del objeto.
Para comprobar el estado del trabajo en proceso, se puede observar en el icono situado en la parte superior derecha de la pantalla:
